北京大學第三醫院是國內最早開展輔助生殖技術研究和臨床應用的醫療機構之一。自1992年開始開展人類試管嬰兒后，北京大學第三醫院已成為全國范圍內輔助生殖技術治療領域最具規模、最具影響力和最具實力的專業機構之一。在試管嬰兒技術方面，北京大學第三醫院所采用的是目前國際上最先進、最安全、成功率最高、并能減少胚胎損傷和提高受孕率等多項優點的微創IVF（微創體外受精）技術。

值得一提的是，北京大學第三醫院試管嬰兒中心所擁有的醫療設備也是非常優秀的。例如，其配備了全球公認的最先進的"日本愛育之助"培養基和胚胎移植裝置，同時采用“時間分辨激光共聚焦顯微鏡”進行胚胎發育觀察，實現了對人類早期胚胎發育過程、質量評價及選擇等方面的高精度控制。