3bb囊胚和4bb囊胚最主要的區別就在于囊胚發程度的不同，3bb囊胚中的“3”表示囊胚處于完全擴張中，囊胚腔完全占據了胚胎的總體積。而4bb囊胚中的“4”表示擴張囊胚，囊胚腔完全充滿胚胎，胚胎總體積變大，透明帶變薄。除此之外，兩者的內細胞團和滋養層細胞都是相同的，這兩者屬于同一個級別的囊胚，進行胚胎移植的成功率是相同的，沒有多大的區別。