男性患有乙肝是可以做三代試管嬰兒來避免遺傳的。乙肝的病毒復制率高、傳染性強，這種情況就會導致染色體異常，影響成功率，這個時候可以通過三代試管嬰兒，在移植前進行胚胎染色體篩查，挑選出健康的胚胎進行移植，進而降低下一代感染乙肝的可能，實現優生優育的目的。
第三代試管嬰兒能有效阻斷后代患乙肝的可能。乙肝不是遺傳性疾病，主要就是家族性傳播，母嬰垂直傳播，母親如果是乙肝E抗原陽性，所生子女未注射乙肝疫苗，大都成為乙肝病毒攜帶。在試管前會對男女雙方進行血液檢查，檢查體內是否帶有乙肝病毒。所以，經過檢查是能夠篩查出男女方是否攜帶有乙肝病毒的。
