二代轉三代試管嬰兒風險不是特別大，只是三代試管嬰兒技術會針對遺傳性疾病進行篩查，因此對于胚胎多少會有一定的損傷，有可能會出現培育失敗的現象，那么就沒有胚胎可以進行移植，從而導致試管嬰兒失敗。另外，雖然三代試管出現胎停的幾率較小，但如果出現染色體異常、子宮內膜缺血或者母體存在疾病的話，就大概率會胎停。
正常情況下，二代試管轉三代試管存在一定風險，因為該技術只是一項醫療技術，沒有辦法保證100%成功的，而且醫療技術都會伴隨著風險。在做第三代試管嬰兒前，了解其風險也是很有必要的：
1、損傷胚胎
胚胎篩查對胚胎是有一定的損傷率，一個囊胚中有150-200個細胞，PGS采樣需要從中取出5-6個細胞，并不是簡單粗暴地戳入胚胎內部直接提取。即使這樣也可能會對胚胎有千分之1到千分之2的損傷率。
2、試管失敗
第三代試管嬰兒技術要求相對比較嚴謹，如果精子或卵子的質量不是特別好的情況下，更容易出現失敗的現象，所以相對于一代和二代試管嬰兒技術而言，三代試管嬰兒的技術會更難一些。
3、多胎妊娠
三代試管嬰兒會使受孕幾率增高，但容易出現多胎妊娠，使孕婦出現高危妊娠的情況，容易導致孕期高血壓、糖尿病等并發癥的發生。此外多胎妊娠還會增加剖腹產率以及產后出血等風險。
4、經濟風險
除了技術上的要求以外，三代試管嬰兒的費用要明顯高于一代和二代，因此經濟條件不是很好的家庭，可能負擔起來會比較吃力，如果失敗的話，就會承擔較大的經濟風險。
雖然三代試管試管嬰兒技術的風險有很多，但是其優勢也是比較明顯的，可以幫助夫婦選擇最健康、最有潛力的胚胎進行移植，提高妊娠成功率和生育健康寶寶的機會，此若是有需求可以到正規專業的醫院來進行檢查和咨詢。
其實三代試管出現胎停的概率是比較低的，研究表明，60%以上的胚胎停育都是染色體異常導致的，而三代試管嬰兒技術現在可以篩選掉90%以上的常見染色體疾病，從而使胎停育的概率大幅度下降。
但是，出現胎停的幾率雖然比較小，但不代表不存在，現在并不能排除孕婦在受孕以后受病毒感染，胚胎毒性藥物的影響，從而引起胚胎停育現象。因此做三代試管成功懷孕后，一定要多多注意，并按時產檢。
